Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms