Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms