Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERV1

Mkrn2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn2Q9ERV1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Mkrn2Q9ERV1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Mkrn2Q9ERV1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Mkrn2Q9ERV1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn2Q9ERV1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms