Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cse1lQ9ERK4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms