Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hipk3Q9ERH7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hipk3Q9ERH7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hipk3Q9ERH7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hipk3Q9ERH7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hipk3Q9ERH7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hipk3Q9ERH7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hipk3Q9ERH7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hipk3Q9ERH7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hipk3Q9ERH7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hipk3Q9ERH7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hipk3Q9ERH7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hipk3Q9ERH7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hipk3Q9ERH7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hipk3Q9ERH7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hipk3Q9ERH7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hipk3Q9ERH7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Hipk3Q9ERH7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
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