Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Stx12Q9ER00 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms