Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SyncQ9EPM5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms