Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK6

Sil1, Nucleotide exchange factor SIL1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sil1Q9EPK6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sil1Q9EPK6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms