Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xab2Q9DCD2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms