Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slx4ipQ9D7Y9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms