Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms