Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms