Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdr42e1Q9D665 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms