Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PudpQ9D5U5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PudpQ9D5U5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms