Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc83Q9D4V3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms