Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lonrf3Q9D4H7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms