Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Syce1Q9D495 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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