Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx20Q9D2Y5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx20Q9D2Y5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx20Q9D2Y5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx20Q9D2Y5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx20Q9D2Y5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx20Q9D2Y5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx20Q9D2Y5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx20Q9D2Y5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx20Q9D2Y5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx20Q9D2Y5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx20Q9D2Y5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx20Q9D2Y5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx20Q9D2Y5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx20Q9D2Y5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx20Q9D2Y5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx20Q9D2Y5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx20Q9D2Y5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx20Q9D2Y5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx20Q9D2Y5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx20Q9D2Y5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx20Q9D2Y5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx20Q9D2Y5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx20Q9D2Y5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx20Q9D2Y5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx20Q9D2Y5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx20Q9D2Y5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx20Q9D2Y5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx20Q9D2Y5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx20Q9D2Y5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx20Q9D2Y5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx20Q9D2Y5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx20Q9D2Y5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx20Q9D2Y5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx20Q9D2Y5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx20Q9D2Y5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx20Q9D2Y5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx20Q9D2Y5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx20Q9D2Y5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx20Q9D2Y5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx20Q9D2Y5 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Snx20Q9D2Y5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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Snx20Q9D2Y5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx20Q9D2Y5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms