Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Trappc6bQ9D289 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Trappc6bQ9D289 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Trappc6bQ9D289 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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