Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krtap5-3Q9D226 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms