Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Mrpl28Q9D1B9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Mrpl28Q9D1B9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Mrpl28Q9D1B9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Mrpl28Q9D1B9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Mrpl28Q9D1B9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Mrpl28Q9D1B9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Mrpl28Q9D1B9 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Mrpl28Q9D1B9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Mrpl28Q9D1B9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Mrpl28Q9D1B9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Mrpl28Q9D1B9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Mrpl28Q9D1B9 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Mrpl28Q9D1B9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Mrpl28Q9D1B9 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Mrpl28Q9D1B9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Mrpl28Q9D1B9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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