Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem53Q9D0Z3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms