Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gtf2e1Q9D0D5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms