Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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Spc24Q9D083 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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Spc24Q9D083 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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Spc24Q9D083 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Spc24Q9D083 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Spc24Q9D083 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Spc24Q9D083 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Spc24Q9D083 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Spc24Q9D083 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Spc24Q9D083 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Spc24Q9D083 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Spc24Q9D083 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Spc24Q9D083 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Spc24Q9D083 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Spc24Q9D083 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spc24Q9D083 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms