Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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