Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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