Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx10Q9CWT3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx10Q9CWT3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms