Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms