Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH3

Ndufb5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb5Q9CQH3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb5Q9CQH3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb5Q9CQH3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb5Q9CQH3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb5Q9CQH3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb5Q9CQH3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ndufb5Q9CQH3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ndufb5Q9CQH3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb5Q9CQH3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms