Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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