Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC0

Tpbpb, Trophoblast-specific protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpbpbQ9CQC0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TpbpbQ9CQC0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms