Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms