Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Rnaseh2cQ9CQ18 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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