Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Commd4Q9CQ02 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms