Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl17Q9CPR4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl17Q9CPR4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms