Protein–RNA interactions for Protein: Q99PP9

Trim16, Tripartite motif-containing protein 16, mousemouse

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Length 556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim16Q99PP9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim16Q99PP9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Trim16Q99PP9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Trim16Q99PP9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Trim16Q99PP9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Trim16Q99PP9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Trim16Q99PP9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Trim16Q99PP9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Trim16Q99PP9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Trim16Q99PP9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Trim16Q99PP9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim16Q99PP9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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