Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ubqln4Q99NB8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ubqln4Q99NB8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubqln4Q99NB8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ubqln4Q99NB8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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