Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms