Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR3

Slc12a9, Solute carrier family 12 member 9, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a9Q99MR3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms