Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms