Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q99KU6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q99KU6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q99KU6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q99KU6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q99KU6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q99KU6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q99KU6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q99KU6 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q99KU6 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q99KU6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q99KU6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q99KU6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q99KU6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q99KU6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q99KU6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q99KU6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q99KU6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q99KU6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q99KU6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q99KU6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q99KU6 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q99KU6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q99KU6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q99KU6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q99KU6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q99KU6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Q99KU6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q99KU6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q99KU6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q99KU6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q99KU6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q99KU6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Q99KU6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q99KU6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q99KU6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q99KU6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q99KU6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q99KU6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q99KU6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q99KU6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q99KU6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q99KU6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q99KU6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q99KU6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q99KU6 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Q99KU6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q99KU6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q99KU6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q99KU6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q99KU6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q99KU6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q99KU6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q99KU6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Q99KU6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q99KU6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q99KU6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q99KU6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q99KU6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q99KU6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q99KU6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q99KU6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q99KU6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q99KU6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q99KU6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q99KU6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q99KU6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q99KU6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q99KU6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q99KU6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q99KU6 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q99KU6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q99KU6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Q99KU6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q99KU6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q99KU6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q99KU6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q99KU6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q99KU6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q99KU6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q99KU6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q99KU6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q99KU6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q99KU6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q99KU6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q99KU6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q99KU6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q99KU6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q99KU6 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q99KU6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q99KU6 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q99KU6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q99KU6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q99KU6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q99KU6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q99KU6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q99KU6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q99KU6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q99KU6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q99KU6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms