Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrabdQ99JY4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms