Protein–RNA interactions for Protein: Q922R1

UPF0183 protein C16orf70 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q922R1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q922R1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q922R1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q922R1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q922R1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q922R1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q922R1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q922R1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q922R1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q922R1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q922R1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q922R1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q922R1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q922R1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q922R1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q922R1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q922R1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q922R1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q922R1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q922R1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q922R1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q922R1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q922R1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q922R1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q922R1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q922R1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q922R1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q922R1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q922R1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q922R1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q922R1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q922R1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q922R1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q922R1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q922R1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q922R1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q922R1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q922R1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q922R1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q922R1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q922R1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q922R1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q922R1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q922R1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q922R1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q922R1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q922R1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q922R1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q922R1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q922R1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q922R1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q922R1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q922R1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q922R1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q922R1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q922R1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q922R1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q922R1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q922R1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q922R1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q922R1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Q922R1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q922R1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q922R1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q922R1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Q922R1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q922R1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q922R1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q922R1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q922R1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q922R1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q922R1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q922R1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q922R1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q922R1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q922R1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q922R1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q922R1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q922R1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q922R1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q922R1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q922R1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q922R1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q922R1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q922R1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q922R1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q922R1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q922R1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q922R1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q922R1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q922R1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q922R1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q922R1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q922R1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q922R1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q922R1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q922R1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q922R1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q922R1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q922R1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms