Protein–RNA interactions for Protein: Q922L6

Nelfcd, Negative elongation factor D, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfcdQ922L6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NelfcdQ922L6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms