Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb6Q922F4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms