Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms