Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csde1Q91W50 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms