Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms