Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul7Q8VE73 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms