Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Smg8Q8VE18 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Smg8Q8VE18 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Smg8Q8VE18 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Smg8Q8VE18 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Smg8Q8VE18 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Smg8Q8VE18 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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